يعد مستشفى ابن الهيثم من افضل المراكز العلاجية التخصصية ليس في الأردن فقط وإنما في بلدان المنطقة أيضا، فبالإضافة الى كونه مستشفى عام يضم كافة التخصصات من باطنية، أطفال، نسائية وتوليد، وجراحة عامة وجراحة خاصة، وغيرها فهو يضم مراكز طبية متعددة ومتقدمة تقنيا.

إن مستشفى ابن الهيثم اصبح من العلامات المميزة في الخدمات الطبية الدقيقة على مستوى العالم حيث يعتبر المركز السابع عشر في العالم في معالجة أورام وأمراض الدماغ بواسطة أشعة الجاما-نايف في مركز عمان للجاما-نايف ) radoisurgery by gamma-knife )، بالإضافة الى علاج أورام الدماغ بواسطة الجراحة الثلاثية الأبعاد (steriotactic surgery ) . وقد استحدث حديثا مركز الجراحة المصوبة لمعالجة مرضى الشلل الرعاشي (Parkinson )، وأجريت لغاية الآن في هذا المركز العديد من الحالات والتي تمت بنجاح فائق مميز، كما يحتوي المستشفى على مركز حديث لأمراض القلب وجراحتها وجهاز قسطرة القلب والعناية المركزة لمرضى القلب بالإضافة الى انه قد تم استحداث مركز لمعالجة التشوهات في العمود الفقري، أما في مركز الكلى فقد تم إجراء العديد من عمليات زراعة الكلى والتي تكللت بنجاح تام . علاوة على أن مستشفى ابن الهيثم يعتبر المركز الرائد في معالجة أمراض وجراحة العيون وزراعة القرنيات حيث تم حتى تاريخه زراعة ما يزيد على خمسمائة قرنية تكللت كلها بنجاح تام.

إن مستشفى ابن الهيثم يساهم مساهمة فعالة في إجراء المسح الطبي لشرائح معينة من المجتمع لاكتشاف أمراض هشاشة العظام (osteoporosis ) لمعالجتها وذلك من خلال التشخيص بواسطة أول جهاز من نوعه في المنطقة لقياس هشاشة العظام (bone densitometry ).